国有企业因旷工被辞退，正在进行仲裁。公司说把辞退证明放进我的档案合法吗？

你好，可以申请劳动仲裁
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法律分析：旷工辞退需要办理以下手续：1.通知被辞退人员相关情况，并出具解除劳动合同通知书；2.按离职要求办理离职手续，向劳动者出具离职证明、住房公积金等相关手续，结清工资；3.给劳动者办理社保停缴等手续，并在人事台帐上进行备注。法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》 第五十条 用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。
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旷工辞退若是在国企或者事业单位的会记入档案。国企或事业单位有权管理档案，若是劳动者旷工导致辞退的，原用人单位可能会记录在人事档案中，会影响劳动者的再次就业。法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第五十条
用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。
用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。